ארבעת הפרקים האחרונים של The Clone Wars מתרחשים במקביל ל-Revenge of the Sith, הסרט האחרון של טרילוגיית ה-Star Wars. זה כולל צו 66 ונפילת מסדר הג'דיי.
היבט לא ידוע של מלחמת הכוכבים היה כיצד אהסוקה טנו אהובת המעריצים שרדה את סדר 66. שני הפרקים האחרונים של הסדרה מראים כיצד Ahsoka נמלט.
Shattered
בפרקים התשיעי והעשירי של העונה, דארת' מול טמן מלכודת בכוונה להרוג את אנאקין סקייווקר לפני שדארת' סידיוס יוכל להפוך אותו לצד האפל. עם זאת, אנאקין היה עסוק בהצלת הקנצלר פלפטין מגנרל גריווס כפי שמתואר ברצף הפתיחה של נקמת הסית'.אז אחסוקה התעמת עם מול במקום זאת. הפרק העשירי מסתיים בלכידתו של Maul.
רץ הסדרה דייב פילוני אמר ל-Entertainment Weekly, "משהו שרציתי לעשות כבר הרבה זמן הוא שסוף מלחמות המשובטים יהיה הסיפור המקביל הזה שממסגר את המקום שבו חלק מהאנשים האלה לא היו. הסרטים הם. כי אני חושב שזו לבדה שאלה נכונה: איפה היו החבר'ה האלה? אחסוקה נראתה כאילו היא חשובה, אז היא הוזמנה להצטרף לסית'? איפה היה רקס? הרגשתי שצריך תשובה כי הם היו, אחרי כל כך הרבה פרקים וסיפורים, ברור שחלק כל כך גדול מהחיים של אנאקין ואובי-וואן."
בפרק האחד-עשר, שכותרתו "Shattered", Ahsoka מנסה להביא את מול לקורוסנט עם מפקד שיבוט בשם רקס וגדוד של חיילים משובטים. קישורים נוספים ל-Revenge of the Sith מתרחשים. משוחזרת סצנה מהסרט; בסצנה, מייס ווינדו ויודה דנים בפלפטין והדחתו מתפקידו לאחר התבוסה של גנרל גריוווס עם חברי מועצת ג'די אחרים.הסצנה מורחבת בדיון הבא עם Ahsoka.
בעודם מטיילים בחלל, אהסוקה ומול חשים שניהם בנפילתו של המאסטר לשעבר של אחסוקה. הקלטת הדיאלוג בפועל מתוך Revenge of the Sith עם היידן כריסטנסן, סמואל ל. ג'קסון ואיאן מקדיארמיד כשהדמויות שלהם משחקות על הסצנה.
בעקבות תורו של אנאקין, סידיוס מפעיל את סדר 66. שבבי מעכבים הונחו בכל משבט שיבוט. כאשר צו 66 מוכרז, הם נאלצים להרוג כל ג'דיי בניגוד לרצונם. לאחר מתן הפקודה, רקס והשיבוטים שלו תוקפים את Ahsoka.
ניצחון ומוות
עם הרצון החופשי של רקס ששוחזר, השניים מנסים להימלט מסיירת הרפובליקה בסיום הסדרה שכותרתו "ניצחון ומוות". זה נעשה מסובך יותר על ידי Maul אשר הורס את ההיפר-דרייב של הספינה. זה הופך את הסיירת לחסרת תועלת למדי שכן היא נמשכת על ידי כוח המשיכה של ירח.
כשהסיירת נוטה לעבר פני הירח, מול נמלט באמצעות מעבורת, ככל הנראה אל השפה החיצונית, שם הוא נודע בשם Crimson Dawn כפי שניתן לראות בסרט סולו: סיפור מלחמת הכוכבים.
רקס ואסוקה משתמשים ב-Y-Wing כדי לנחות בבטחה על פני הירח כשהסיירת מתרסקת והורגת את כל השיבוטים על הסיפון. השניים קוברים את חבריהם שנפלו ואסוקה משאירה את חרב האור שלה בקבר.
הפרק מסתיים בגדוד של חיילי סערה שסקר את אתר ההתרסקות מכוסה כעת בשלג. דארת' ויידר איתם. ויידר מוצא את חרב האור של אחסוקה; זה שהוא העניק לה ב"חברים ותיקים לא נשכחים", הפרק התשיעי של העונה האחרונה.
פילוני אמר לחדשות ABC, "אני מקווה שהמעריצים יעזבו מרמה אחת מרוצים מאוד, ואני מקווה שהם יעזבו עם הבנה גדולה יותר, במיוחד של הג'דיי והכוח ומה כל זה אומר בסיפור הזה. זה באמת קשור ל- תווים בסוף."
אחרי מלחמות השיבוט
הסיפור של Ahsoka ממשיך לאחר הסדרה. הרומן אחסוקה, שכתב א.ק. ג'ונסטון, עוקבת אחר מסעה של אחסוקה שנה לאחר צו 66 ומספרת כיצד פגשה את בייל אורגנה, אביה המאומץ של ליה, והצטרפה למרד.
Ahsoka מופיע בשתי העונות הראשונות של Star Wars Rebels המתרחשת 14 שנים לאחר The Clone Wars כסוכן מורדים. במהלך העונה השנייה, אחסוקה מגלה את האמת שהמאסטר לשעבר שלה, אנאקין סקייווקר, הוא דארת' ויידר. השניים נלחמים וגורלו של אחסוקה נותר מעורפל. עם זאת, בעונה הרביעית נחשף כי אחסוקה ניצלה על ידי עזרא, הדמות הראשית של הסדרה. אחסוקה חי כדי לראות את סוף האימפריה.
לאהסוקה היה קול קמיע ב"עלייתו של סקייווקר" ולפי השמועות הוא יופיע בעונה השנייה של The Mandalorian.
